Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms