Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Podnl1Q6P3Y9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms