Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms