Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms