Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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