Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms