Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80dQ66JY2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms