Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms