Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top2bQ64511 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top2bQ64511 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms