Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vat1Q62465 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms