Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorbs1Q62417 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms