Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TsnQ62348 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TsnQ62348 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TsnQ62348 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TsnQ62348 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms