Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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