Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms