Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Trim38Q5SZ99 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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