Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myh1Q5SX40 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myh1Q5SX40 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myh1Q5SX40 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myh1Q5SX40 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myh1Q5SX40 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myh1Q5SX40 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myh1Q5SX40 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myh1Q5SX40 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms