Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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