Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Smim26Q3V460 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Smim26Q3V460 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms