Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms