Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3USZ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3USZ8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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