Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Snx27Q3UHD6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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