Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms