Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms