Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms