Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms