Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox9Q04887 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms