Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms