Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms