Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms