Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl21cP86793 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms