Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gfi1P70338 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gfi1P70338 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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