Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms