Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PlnP61014 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PlnP61014 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PlnP61014 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PlnP61014 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PlnP61014 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PlnP61014 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PlnP61014 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PlnP61014 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PlnP61014 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms