Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NcstnP57716 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms