Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms