Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms