Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Resp18P47939 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms