Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms