Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sar1aP36536 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms