Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab21P35282 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab21P35282 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms