Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprmP28828 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprmP28828 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprmP28828 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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