Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xrcc5P27641 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms