Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf239P24399 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms