Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HdcP23738 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HdcP23738 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms