Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja1P23242 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms