Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klra1P20937 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms