Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms