Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VimP20152 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VimP20152 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VimP20152 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VimP20152 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms