Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NefhP19246 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms