Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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